指挥官主线任务的起点是完成第二场梦系列任务，这是接触游戏核心设定的开始，完成后你便可以按特定的按键将指挥官从战甲中召唤出来，不过此时的指挥官能力还非常基础，行动范围有限，技能也很简单，但此任务至关重要，它深刻揭示了天诺战士的起源秘密，并为你开启了后期战力成长的根基——专精系统。
要让你的指挥官获得真正的行动自由，必须紧接着完成内战任务，这个任务是指挥官能力的一次巨大解放，完成之后，指挥官将突破战甲的束缚，能够作为一个独立的角色在战场上自由移动、奔跑和跳跃，其操作方式会变得和战甲类似，同时任务的剧情会进一步阐述指挥官与战甲之间深刻而复杂的关系，为你理解整个游戏的世界观提供关键信息，完成这个任务通常还能获得一些实用的奖励。
在指挥官获得自由行动的能力后，其完全体的塑造与专精系统的深入解锁紧密相连，这通常涉及与夜羽等特定阵营的互动，指挥官拥有自己专属的武器系统，称为增幅器，最初的装备比较初级，后续更强大的增幅器部件需要通过在开放平原活动中积累声望来兑换和制作，不同的部件组合能适应不同的战斗场景，专精系统则提供了五种不同的发展流派，每种流派都有其独特的虚空能力方向，你需要根据自己的战斗风格进行选择和长期积累经验来解锁强化。
指挥官主线任务是层层递进的，推进它们需要你关注星图的探索进度和账号等级的提升，许多关键的主线任务都隐藏在星球之间的接合点挑战之后，如果你的星图节点没有开到相应位置，或者战甲等级等前置条件未满足，任务就不会出现，在任务过程中，注意跟随游戏内的导航标记和剧情通讯指引，它们会为你指明下一步的目标，整个任务链不仅是获得强大能力的过程，更是一段逐步揭开始源星系历史真相和天诺使命的沉浸式旅程。
